在傳統的文檔提交方式中，大量的紙張被使用。例如藥品申報等各類需要提交文件的流程，往往需要打印出厚厚的紙質文檔。這些紙張的生產需要消耗大量的木材資源，從樹木的砍伐到紙張的制造過程，涉及到一系列復雜的工序，這其中還伴隨著能源的消耗以及化學物質的使用。
而eCTD電子提交則大大減少了紙張的使用需求。各個相關企業和機構可以直接通過電子系統提交各類文件。據相關研究顯示，僅一個中型規模的申報流程采用eCTD電子提交，相比傳統紙質提交，每年可節約紙張數以萬計。這不僅減少了對木材資源的依賴，也在一定程度上降低了造紙過程中產生的污染，包括廢水排放和化學藥劑殘留等問題。
紙張的運輸也是一個不可忽視的環節。大量紙質文件需要在不同的部門和地區之間運輸，這就需要交通工具的參與，從而產生燃油消耗和尾放。eCTD電子提交完全避免了這一環節的資源消耗和污染產生。
傳統紙質文件的處理過程中，涉及到許多環節的能源消耗。首先是打印設備的使用，打印機在工作過程中需要消耗電能，而且一些大型的打印設備功率較大，長時間的使用會消耗相當可觀的電量。
在文件的存儲和管理方面，紙質文件需要專門的空間進行存放，為了保證文件的安全和可查閱性，這些存放空間往往需要保持適宜的溫度和濕度，這就需要空調等設備的持續運行，進一步增加了能源的消耗。
eCTD電子提交后，電子文件的存儲和管理主要依賴于數據中心。雖然數據中心也需要消耗能源，但現代的數據中心在不斷提高能源利用效率。而且相比于眾多分散的紙質文件存儲點，數據中心在規模效應下能夠更優化地利用能源。根據相關統計，從長遠來看，電子提交系統在能源消耗方面相較于傳統紙質文件處理有著明顯的優勢。
紙質文件在使用過程中會產生許多廢棄物。比如廢棄的打印紙張、墨盒、硒鼓等。這些廢棄物如果處理不當，會對環境造成嚴重的污染。墨盒和硒鼓中含有化學物質，如墨粉等，隨意丟棄可能會滲入土壤和水源，對土壤和水體生態系統產生破壞。
而eCTD電子提交不會產生這類與紙質文件相關的廢棄物。在傳統的紙質文件印刷過程中，會使用油墨等化學物質，這些化學物質在印刷過程中可能會揮發到空氣中，對室內空氣質量產生影響，并且在生產過程中如果處理不當也會對周邊環境造成污染。電子提交則完全避免了這些由于油墨等化學物質帶來的污染風險。
eCTD電子提交在環保方面有著多方面的積極影響。從紙張節約到能源消耗的降低，再到減少廢棄物和化學污染等，它符合現代社會對環保的追求。在未來，隨著數字化技術的不斷發展，應該進一步推廣eCTD電子提交的應用范圍，并且不斷優化電子提交系統的環保性能，例如提高數據中心的綠色能源使用比例等，以更好地實現環保目標。
